Добрый день! У нас такая ситуация...хотим пожениться, я - гражданин РФ, есть сын, 3 года.

Добрый день пожениться можете в России, это быстрее. Далее ваша супруга должна получить  разрешение для Вас и вашего сына на воссоединение семьи. После получения разрешения Вам нужно записаться в Консульство Испании, подготовить несколько документов и подать их на визу по воссоединению семьи. Такие визы рассматриваются быстро. По приезде в Испанию получите карточку резидента, как Вы, так и ваш сын.