Здравствуйте. У меня есть временная защита в Испании, но я хотел бы отказаться от неё и оформить защиту в Германии, так как там проживает моя сестра. Подскажите, пожалуйста, обязательно ли для отказа обращаться именно в тот комиссариат, где я её оформлял,

Где оформлять отказ?

Для отказа от временной защиты в Испании не обязательно ехать именно в тот комиссариат, где Вы изначально получали документы. Формально Вы можете обратиться в любое отделение полиции в Испании, занимающееся миграционными вопросами и вопросами оформления временной защиты. 

Однако на практике удобнее всего это сделать в комиссариате по месту Вашего текущего проживания в Испании. Вам нужно будет подать заявление о добровольном отказе от временной защиты.

Нужно ли указывать причину?

Да, причина отказа должна быть указана.

Какую причину указать? Самый оптимальный и прозрачный вариант — указать "Переезд в другую страну ЕС в связи с наличием там близких родственников" (Traslado a otro país de la UE por reagrupación familiar / motivos familiares).